Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P58686 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P58686 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms