Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bace1P56818 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bace1P56818 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms