Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp5bP56480 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms