Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtswP56203 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtswP56203 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtswP56203 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CtswP56203 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtswP56203 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtswP56203 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtswP56203 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtswP56203 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtswP56203 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtswP56203 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtswP56203 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtswP56203 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtswP56203 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtswP56203 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtswP56203 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms