Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PctpP53808 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PctpP53808 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms