Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FanccP50652 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FanccP50652 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FanccP50652 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FanccP50652 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms