Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TspoP50637 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TspoP50637 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TspoP50637 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TspoP50637 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TspoP50637 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms