Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms