Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt6aP50446 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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