Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms