Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms