Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tnfsf9P41274 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tnfsf9P41274 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tnfsf9P41274 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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