Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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Rpl28P41105 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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Rpl28P41105 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms