Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2aP35436 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2aP35436 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms