Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms