Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc3P33622 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc3P33622 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms