Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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