Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms