Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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