Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PdgfraP26618 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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