Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CftrP26361 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CftrP26361 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CftrP26361 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CftrP26361 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CftrP26361 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CftrP26361 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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