Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms