Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpcP21841 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms