Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Fcer1aP20489 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Fcer1aP20489 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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