Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou4f1P17208 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms