Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RhoP15409 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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