Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms