Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DmdP11531 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms