Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GzmbP04187 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms