Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01853 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01853 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01853 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01853 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01853 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01853 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01853 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01853 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01853 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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