Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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