Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Stra6O70491 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Stra6O70491 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stra6O70491 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Stra6O70491 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Stra6O70491 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Stra6O70491 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stra6O70491 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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