Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms