Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ptpn20O55082 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms