Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffaO54786 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DffaO54786 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DffaO54786 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
DffaO54786 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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