Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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