Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Bnc1O35914 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Bnc1O35914 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bnc1O35914 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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