Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cited2O35740 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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