Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc1O35704 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sptlc1O35704 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sptlc1O35704 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sptlc1O35704 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sptlc1O35704 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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