Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2bO35690 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms