Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms