Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms