Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms