Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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