Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms