Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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