Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms