Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm5294J3QP53 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm5294J3QP53 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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