Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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E030018B13RikJ3QMS9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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E030018B13RikJ3QMS9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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E030018B13RikJ3QMS9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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E030018B13RikJ3QMS9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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E030018B13RikJ3QMS9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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E030018B13RikJ3QMS9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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E030018B13RikJ3QMS9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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