Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm11236J3QMS7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm11236J3QMS7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm11236J3QMS7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm11236J3QMS7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm11236J3QMS7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm11236J3QMS7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm11236J3QMS7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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